Все изменения нужно вносить на сайте Codepen (это очень удобно, т. к. вы видите сразу изменения), после того как на сайте Codepen нажмёте кнопку СОХРАНТЬ, изменения сразу вступят в силу и на тильде. Если вы там удалите скрипт, то и в тильде он пропадёт. Рекомендую все скрипты хранить у себя на аккаунте, так их никто не удалит и не изменит.